Başbakanlık Kupası ilk kez 1944'te, son kez de 1998'de olmak üzere toplam 35 kez düzenlenmiş olup
Fenerbahçe bu kupaya 15 kez katılmış ve kupayı 8 kez kazanmıştır
(1945, 1946, 1950, 1972-73, 1979-80, 1988-89, 1992-93 ve 1997-98).
Fenerbahçe'nin Başbakanlık Kupası istatistikleri ve oynadığı maçların detayları ise şu şekilde:
| TURNUVA | O | G | B | M | A | Y |
| Başbakanlık Kupası | 15 | 8 | 2 | 5 | 29 | 24 |
| BAŞBAKANLIK KUPASI GOLCÜLERİ | |
| Cemil Turan | 5 |
| Aykut Kocaman | 2 |
| Kemalettin Şentürk | 2 |
| Bülent Uygun | 2 |
| Şenol Çorlu | 2 |
| Naci Bastoncu | 2 |
| Müzdat Yetkiner | 2 |
| Mecnur Çolak | 1 |
| Selçuk Yula | 1 |
| John Moshoeu | 1 |
| Ersoy Sandalcı | 1 |
| Yaşar Mumcuoğlu | 1 |
| Alpaslan Eratlı | 1 |
| Melih Kotanca | 1 |
| Halit Deringör | 1 |
| Samim Var | 1 |
| Lefter Küçükandonyadis | 1 |
| Erol Keskin | 1 |
| Halil Köksalan | 1 |
| TOPLAM | 29 |
